Полинуклеотид-5-гидроксил-киназа - Википедия - Polynucleotide 5-hydroxyl-kinase

АТФ-зависимая полидезоксирибонуклеотид-5'-гидроксил-киназа
Идентификаторы
Номер ЕС2.7.1.78
Количество CAS37211-65-7
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO

В энзимология, а полинуклеотид 5'-гидроксил-киназа (EC 2.7.1.78 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

АТФ + 5'-дефосфо-ДНК АДФ + 5'-фосфо-ДНК

Таким образом, два субстраты этого фермента АТФ и 5'-дефосфо-ДНК, а его два товары находятся ADP и 5'-фосфо-ДНК. Полинуклеотидкиназа - это Бактериофаг Т7 (или же Бактериофаг Т4 ) фермент который катализирует передачу гамма-фосфат из АТФ бесплатно гидроксил конец 5 ' ДНК или же РНК. Полученный продукт можно использовать для концевых меток ДНК или РНК или в реакциях лигирования.

Номенклатура

Этот фермент принадлежит к семейству трансферазы, особенно те, которые переносят фосфорсодержащие группы (фосфотрансферазы ) с спиртовой группой в качестве акцептора. В систематическое название этого класса ферментов АТФ: 5'-дефосфополинуклеотид 5'-фосфотрансфераза. Другие широко используемые имена включают:

  • АТФ: 5'-дефосфополинуклеотид 5'-фосфатаза
  • PNK
  • полинуклеотид-5'-гидроксилканаза (фосфорилирование),
  • 5'-гидроксил полинуклеотидкиназа,
  • 5'-гидроксилполирибонуклеотидкиназа,
  • 5'-гидроксил РНК киназа,
  • ДНК 5'-гидроксилкиназа,
  • ДНК-киназа,
  • полинуклеотидкиназа и
  • полинуклеотид-5'-гидроксикиназа.

Рекомендации

  • Новогродский А, Гурвиц Дж (1966). «Ферментативное фосфорилирование рибонуклеиновой кислоты и дезоксирибонуклеиновой кислоты. I. Фосфорилирование на 5'-гидроксильных концах». J. Biol. Chem. 241 (12): 2923–32. PMID  4287929.
  • Новогродский А, Таль М, Трауб А, Гурвиц Дж (1966). «Ферментативное фосфорилирование рибонуклеиновой кислоты и дезоксирибонуклеиновой кислоты. II. Другие свойства 5'-гидроксил полинуклеотидкиназы». J. Biol. Chem. 241 (12): 2933–43. PMID  4287930.

внешняя ссылка